El proyecto de drenaje sanitario para esta etapa debió considerar una serie de colectores y de infraestructura existente, así como diversos cruzamientos con cauces y zonas federales, particularmente PEMEX. Al estar ya terminada la etapa 1, se debió encontrar la manera de integrar la nueva etapa y dejar prevista la infraestructura para las subsecuentes. Para esto también hubo la necesidad de considerar que el reactor PTAR no sería suficiente para dar servicio a una segunda etapa. Por lo que se propuso la ampliación del segundo módulo de tratamiento, además de ajustar el procedimiento constructivo.
